Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMX3A6NHT5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms