Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL33A6NCF5 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL33A6NCF5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms