Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
E2F8A0AVK6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms