Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CDC23Q9UJX2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CDC23Q9UJX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDC23Q9UJX2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDC23Q9UJX2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDC23Q9UJX2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDC23Q9UJX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms