Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
KDM5BQ9UGL1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
KDM5BQ9UGL1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
KDM5BQ9UGL1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
KDM5BQ9UGL1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.33■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.32■■■■■ 4.05
KDM5BQ9UGL1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC40.31■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.3■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
KDM5BQ9UGL1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.25■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC40.21■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
KDM5BQ9UGL1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
KDM5BQ9UGL1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms