Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW4

Polm, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolmQ9JIW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PolmQ9JIW4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PolmQ9JIW4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PolmQ9JIW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PolmQ9JIW4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PolmQ9JIW4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PolmQ9JIW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms