Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRPM3Q9HCF6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
TRPM3Q9HCF6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
TRPM3Q9HCF6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
TRPM3Q9HCF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TRPM3Q9HCF6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TRPM3Q9HCF6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRPM3Q9HCF6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms