Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
IFIH1Q9BYX4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IFIH1Q9BYX4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IFIH1Q9BYX4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFIH1Q9BYX4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFIH1Q9BYX4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms