Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ9

KRTAP4-8, Keratin-associated protein 4-8, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-8Q9BYQ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL031058.1-201ENST00000561592 888 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 NRXN1-234ENST00000630656 837 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
KRTAP4-8Q9BYQ9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 FCHO2-201ENST00000287761 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SEPT7P2-208ENST00000444755 505 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL139021.1-201ENST00000556734 436 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 TERB2-201ENST00000340827 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 FAM122C-202ENST00000370785 1344 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 LIPK-201ENST00000404190 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC020763.2-201ENST00000623155 1255 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SERPINA9-201ENST00000298845 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 TCEAL8-202ENST00000372685 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AL162385.1-201ENST00000451595 1202 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC131182.1-201ENST00000509184 657 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 LINC01090-202ENST00000434418 560 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
KRTAP4-8Q9BYQ9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms