Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LRRC7Q96NW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.38■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRRC7Q96NW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRRC7Q96NW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRRC7Q96NW7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRRC7Q96NW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.1 ms