Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT3

GUCD1, Protein GUCD1, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GUCD1Q96NT3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GUCD1Q96NT3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GUCD1Q96NT3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GUCD1Q96NT3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GUCD1Q96NT3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GUCD1Q96NT3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GUCD1Q96NT3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GUCD1Q96NT3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GUCD1Q96NT3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GUCD1Q96NT3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GUCD1Q96NT3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GUCD1Q96NT3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GUCD1Q96NT3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms