Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
EP400Q96L91 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
EP400Q96L91 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
EP400Q96L91 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
EP400Q96L91 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
EP400Q96L91 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
EP400Q96L91 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.81■■■■□ 3
EP400Q96L91 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
EP400Q96L91 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
EP400Q96L91 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EP400Q96L91 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
EP400Q96L91 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
EP400Q96L91 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EP400Q96L91 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EP400Q96L91 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EP400Q96L91 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
EP400Q96L91 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
EP400Q96L91 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EP400Q96L91 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
EP400Q96L91 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.78■■■■□ 3
EP400Q96L91 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
EP400Q96L91 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EP400Q96L91 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EP400Q96L91 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
EP400Q96L91 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
EP400Q96L91 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
EP400Q96L91 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
EP400Q96L91 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms