Protein–RNA interactions for Protein: Q96H15

TIMD4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMD4Q96H15 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TIMD4Q96H15 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TIMD4Q96H15 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TIMD4Q96H15 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TIMD4Q96H15 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms