Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI1

SLC22A18, Solute carrier family 22 member 18, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A18Q96BI1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC22A18Q96BI1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC22A18Q96BI1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC22A18Q96BI1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC22A18Q96BI1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms