Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
FAT3Q8TDW7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAT3Q8TDW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAT3Q8TDW7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
FAT3Q8TDW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FAT3Q8TDW7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FAT3Q8TDW7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAT3Q8TDW7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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