Protein–RNA interactions for Protein: Q8N135

LGI4, Leucine-rich repeat LGI family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI4Q8N135 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LGI4Q8N135 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LGI4Q8N135 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LGI4Q8N135 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LGI4Q8N135 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms