Protein–RNA interactions for Protein: Q86SE8

NPM2, Nucleoplasmin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM2Q86SE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NPM2Q86SE8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
NPM2Q86SE8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NPM2Q86SE8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NPM2Q86SE8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NPM2Q86SE8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.95■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
NPM2Q86SE8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms