Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
SMIM5Q71RC9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SMIM5Q71RC9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
SMIM5Q71RC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SMIM5Q71RC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SMIM5Q71RC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SMIM5Q71RC9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms