Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-203ENST00000460329 3694 ntTSL 513.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 213.29□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-204ENST00000463103 4193 ntTSL 512.86□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSD2-210ENST00000482415 3602 ntTSL 1 (best)12.32□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 MAGI1-217ENST00000611645 6398 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 TAS2R14-201ENST00000381852 1662 ntTSL 211.83□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 PRR4-203ENST00000535024 889 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 AC018630.6-201ENST00000536668 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.682e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.72e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)10.15□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.92e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSMAF-201ENST00000038176 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 TBC1D32-207ENST00000509492 754 ntTSL 38.36□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 TBC1D32-203ENST00000398197 2690 ntTSL 28.18□□□□□ -1.12e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 TBC1D32-206ENST00000464622 5323 ntTSL 27.3□□□□□ -1.242e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSMAF-205ENST00000518229 581 ntTSL 46.93□□□□□ -1.32e-7■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 TBC1D32-209ENST00000523345 429 ntTSL 56.76□□□□□ -1.332e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 PRR4-214ENST00000546317 281 ntTSL 56.64□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.352e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.412e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.432e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 PRH1-202ENST00000536086 554 ntTSL 56.02□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 NSMAF-204ENST00000518159 582 ntTSL 35.3□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 ANKIB1-203ENST00000422095 2036 ntTSL 1 (best)4.65□□□□□ -1.665e-6■■■■■ 34
LARP4Q71RC2 PLEKHJ1-209ENST00000588545 889 ntTSL 220.41■□□□□ 0.862e-17■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.671e-6■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 C19orf24-203ENST00000485191 1675 ntTSL 218.14■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 C19orf24-204ENST00000585716 558 ntTSL 511.97□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 CMC2-218ENST00000567593 919 ntTSL 39.91□□□□□ -0.822e-9■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 PSMA2-202ENST00000411875 4251 ntTSL 1 (best)7.02□□□□□ -1.292e-9■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.312e-7■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.362e-7■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 33.9
LARP4Q71RC2 POLR2L-202ENST00000534030 585 ntTSL 417.53■□□□□ 0.46e-11■■■■■ 33.8
LARP4Q71RC2 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.416e-11■■■■■ 33.8
LARP4Q71RC2 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 33.7
LARP4Q71RC2 ANKRD23-205ENST00000476975 1132 ntTSL 512.46□□□□□ -0.415e-6■■■■■ 33.6
LARP4Q71RC2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 33.6
LARP4Q71RC2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 33.6
LARP4Q71RC2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 33.6
LARP4Q71RC2 AC004148.2-201ENST00000575890 1938 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.131e-6■■■■■ 33.6
LARP4Q71RC2 RPL9-204ENST00000503040 571 ntTSL 44.91□□□□□ -1.623e-18■■■■■ 33.5
LARP4Q71RC2 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.171e-12■■■■■ 33.5
LARP4Q71RC2 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.091e-12■■■■■ 33.5
LARP4Q71RC2 PRDX2-203ENST00000466174 1717 ntTSL 1 (best)15.09■□□□□ 0.011e-20■■■■■ 33.4
LARP4Q71RC2 PRDX2-201ENST00000301522 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.671e-20■■■■■ 33.4
LARP4Q71RC2 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.761e-20■■■■■ 33.4
LARP4Q71RC2 HOOK2-213ENST00000589765 108 ntTSL 58.22□□□□□ -1.091e-20■■■■■ 33.4
LARP4Q71RC2 ITIH3-201ENST00000416872 2220 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.594e-9■■■■■ 33.4
LARP4Q71RC2 ITIH3-202ENST00000449956 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.044e-9■■■■■ 33.4
LARP4Q71RC2 ITIH3-211ENST00000621946 3038 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.084e-9■■■■■ 33.4
LARP4Q71RC2 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 211.09□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 33.4
LARP4Q71RC2 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-46■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 MCU-208ENST00000604372 894 ntTSL 1 (best)25.71■■□□□ 1.719e-8■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.579e-8■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.379e-8■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 MCU-211ENST00000605597 3224 ntTSL 212.75□□□□□ -0.379e-8■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 MCU-204ENST00000536019 3224 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.379e-8■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 MCU-209ENST00000604679 1074 ntTSL 512.49□□□□□ -0.419e-8■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 MCU-206ENST00000603649 473 ntTSL 59.52□□□□□ -0.899e-8■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 MCU-207ENST00000604152 556 ntTSL 55.24□□□□□ -1.579e-8■■■■■ 33.3
LARP4Q71RC2 TSR3-202ENST00000566296 649 ntTSL 314.97□□□□□ -0.013e-25■■■■■ 33.2
LARP4Q71RC2 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC4.52□□□□□ -1.695e-14■■■■■ 33.1
LARP4Q71RC2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.927e-12■■■■■ 33
LARP4Q71RC2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.827e-12■■■■■ 33
LARP4Q71RC2 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 218.17■□□□□ 0.57e-12■■■■■ 33
LARP4Q71RC2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.417e-12■■■■■ 33
LARP4Q71RC2 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 33
LARP4Q71RC2 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.032e-6■■■■■ 33
LARP4Q71RC2 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.232e-6■■■■■ 33
LARP4Q71RC2 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 217.31■□□□□ 0.362e-12■■■■■ 33
LARP4Q71RC2 NDUFB3-201ENST00000237889 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.052e-7■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.392e-7■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 NDUFB3-204ENST00000454214 547 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.115e-9■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.135e-9■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 CD68-203ENST00000584180 891 ntTSL 212.64□□□□□ -0.395e-9■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 521.34■■□□□ 1.011e-19■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 HPN-204ENST00000593305 2175 ntTSL 219.93■□□□□ 0.781e-19■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 HPN-203ENST00000541345 1820 ntTSL 217.29■□□□□ 0.361e-19■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.31e-19■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-19■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-19■■■■■ 32.8
LARP4Q71RC2 RPL41-205ENST00000546654 238 ntTSL 24.86□□□□□ -1.631e-29■■■■■ 32.7
LARP4Q71RC2 CTSH-204ENST00000527715 2138 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.535e-9■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.09■■■□□ 2.092e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-217ENST00000527644 968 ntTSL 224.11■■□□□ 1.452e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.28e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.178e-7■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 TBL1X-205ENST00000422314 496 ntTSL 221.85■■□□□ 1.092e-6■■■■■ 32.5
LARP4Q71RC2 MAGI1-212ENST00000480729 568 ntTSL 221.58■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 32.5
Retrieved 100 of 15,922 protein–RNA pairs in 408 ms