Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CEACAM20Q6UY09 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CEACAM20Q6UY09 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CEACAM20Q6UY09 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CEACAM20Q6UY09 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms