Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRIG3Q6UXM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LRIG3Q6UXM1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIG3Q6UXM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRIG3Q6UXM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms