Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VITQ6UXI7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VITQ6UXI7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VITQ6UXI7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VITQ6UXI7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VITQ6UXI7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VITQ6UXI7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VITQ6UXI7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VITQ6UXI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VITQ6UXI7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VITQ6UXI7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms