Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZFHX3Q15911 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZFHX3Q15911 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZFHX3Q15911 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZFHX3Q15911 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZFHX3Q15911 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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