Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPIDRQ14159 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPIDRQ14159 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SPIDRQ14159 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SPIDRQ14159 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SPIDRQ14159 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms