Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COL4A6Q14031 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
COL4A6Q14031 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COL4A6Q14031 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A6Q14031 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A6Q14031 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A6Q14031 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A6Q14031 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A6Q14031 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COL4A6Q14031 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL4A6Q14031 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A6Q14031 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A6Q14031 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A6Q14031 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A6Q14031 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A6Q14031 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COL4A6Q14031 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COL4A6Q14031 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A6Q14031 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A6Q14031 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A6Q14031 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
COL4A6Q14031 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COL4A6Q14031 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A6Q14031 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A6Q14031 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COL4A6Q14031 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A6Q14031 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A6Q14031 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A6Q14031 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COL4A6Q14031 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
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COL4A6Q14031 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COL4A6Q14031 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COL4A6Q14031 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
COL4A6Q14031 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
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