Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R1AQ13522 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PPP1R1AQ13522 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PPP1R1AQ13522 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PPP1R1AQ13522 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPP1R1AQ13522 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPP1R1AQ13522 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
PPP1R1AQ13522 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PPP1R1AQ13522 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms