Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
STRN3Q13033 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRN3Q13033 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRN3Q13033 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRN3Q13033 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
STRN3Q13033 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
STRN3Q13033 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms