Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TROQ12816 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TROQ12816 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
TROQ12816 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TROQ12816 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TROQ12816 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
TROQ12816 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TROQ12816 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TROQ12816 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
TROQ12816 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TROQ12816 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TROQ12816 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TROQ12816 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TROQ12816 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
TROQ12816 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
TROQ12816 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TROQ12816 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC39.75■■■■□ 3.95
TROQ12816 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TROQ12816 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TROQ12816 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TROQ12816 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TROQ12816 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
TROQ12816 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
TROQ12816 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TROQ12816 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
TROQ12816 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
TROQ12816 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TROQ12816 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TROQ12816 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TROQ12816 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
TROQ12816 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
TROQ12816 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.69■■■■□ 3.94
TROQ12816 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
TROQ12816 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
TROQ12816 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
TROQ12816 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
TROQ12816 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC39.66■■■■□ 3.94
TROQ12816 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
TROQ12816 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
TROQ12816 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
TROQ12816 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
TROQ12816 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TROQ12816 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TROQ12816 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.65■■■■□ 3.94
TROQ12816 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TROQ12816 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
TROQ12816 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
TROQ12816 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.63■■■■□ 3.94
TROQ12816 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TROQ12816 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TROQ12816 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
TROQ12816 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
TROQ12816 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
TROQ12816 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39.61■■■■□ 3.93
TROQ12816 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC39.6■■■■□ 3.93
TROQ12816 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TROQ12816 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TROQ12816 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TROQ12816 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TROQ12816 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TROQ12816 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TROQ12816 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TROQ12816 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TROQ12816 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
TROQ12816 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
TROQ12816 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
TROQ12816 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TROQ12816 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TROQ12816 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TROQ12816 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TROQ12816 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TROQ12816 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
TROQ12816 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TROQ12816 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TROQ12816 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.91
TROQ12816 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
TROQ12816 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
TROQ12816 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TROQ12816 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TROQ12816 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TROQ12816 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TROQ12816 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.48■■■■□ 3.91
TROQ12816 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TROQ12816 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TROQ12816 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TROQ12816 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TROQ12816 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TROQ12816 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TROQ12816 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
TROQ12816 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TROQ12816 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TROQ12816 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TROQ12816 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TROQ12816 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TROQ12816 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TROQ12816 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TROQ12816 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TROQ12816 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TROQ12816 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
TROQ12816 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
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