Protein–RNA interactions for Protein: Q12158

MCD1, Sister chromatid cohesion protein 1, yeastyeast

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MCD1Q12158 CTR1YPR124W 1221 nt8.09□□□□□ -1.11
MCD1Q12158 YMC2YBR104W 990 nt8.09□□□□□ -1.11
MCD1Q12158 MRPL36YBR122C 534 nt8.09□□□□□ -1.11
MCD1Q12158 SAM50YNL026W 1455 nt8.08□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 CIT3YPR001W 1461 nt8.07□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 UFD1YGR048W 1086 nt8.07□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 SRP102YKL154W 735 nt8.07□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 ERG6YML008C 1152 nt8.07□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 VBA3YCL069W 1377 nt8.07□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 CDC10YCR002C 969 nt8.06□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 PET18YCR020C 648 nt8.06□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 STF1YDL130W-A 261 nt8.06□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 LPD1YFL018C 1500 nt8.06□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 GUT1YHL032C 2130 nt8.05□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 YLR280CYLR280C 351 nt8.05□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt8.05□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 YOL079WYOL079W 399 nt8.05□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 TRP1YDR007W 675 nt8.04□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 MPC1YGL080W 393 nt8.04□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 YNL040WYNL040W 1371 nt8.04□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 SVF1YDR346C 1446 nt8.03□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 SWM1YDR260C 513 nt8.03□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 MRS4YKR052C 915 nt8.03□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 HTS1YPR033C 1641 nt8.03□□□□□ -1.12
MCD1Q12158 ELP3YPL086C 1674 nt8.02□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt8.02□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt8.02□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 RAI1YGL246C 1164 nt8.02□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 SER2YGR208W 930 nt8.02□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 NPP2YEL016C 1482 nt8.01□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 TIF2YJL138C 1188 nt8.01□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 TIF1YKR059W 1188 nt8.01□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.01□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 NDJ1YOL104C 1059 nt8.01□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 ERO1YML130C 1692 nt8.01□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 YFR020WYFR020W 699 nt8□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 YIR035CYIR035C 765 nt8□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 YOR300WYOR300W 309 nt8□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 THI3YDL080C 1830 nt8□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 FET5YFL041W 1869 nt8□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 FIT1YDR534C 1587 nt7.99□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 YJL009WYJL009W 327 nt7.99□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 POP2YNR052C 1302 nt7.99□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 CHS7YHR142W 951 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 RSA3YLR221C 663 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 YMR007WYMR007W 381 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 PEX12YMR026C 1200 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 OLA1YBR025C 1185 nt7.98□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 YBR138CYBR138C 1575 nt7.97□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 SUA5YGL169W 1281 nt7.97□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 ERP5YHR110W 639 nt7.97□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 RCR1YBR005W 642 nt7.97□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 UBP13YBL067C 2244 nt7.97□□□□□ -1.13
MCD1Q12158 MIM1YOL026C 342 nt7.96□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 TMS1YDR105C 1422 nt7.95□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt7.95□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 YMR114CYMR114C 1107 nt7.95□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.94□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 YGR210CYGR210C 1236 nt7.94□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 Q0144Q0144 330 nt7.94□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 FCY1YPR062W 477 nt7.94□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 MRI1YPR118W 1236 nt7.94□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 AAT1YKL106W 1356 nt7.94□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 YJR149WYJR149W 1215 nt7.93□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 BUB2YMR055C 921 nt7.93□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 ENP1YBR247C 1452 nt7.93□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 DIT1YDR403W 1611 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 BUD9YGR041W 1644 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 CDC16YKL022C 2523 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 YHC3YJL059W 1227 nt7.92□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 YDR401WYDR401W 564 nt7.91□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 ISY1YJR050W 708 nt7.91□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 YMR166CYMR166C 1107 nt7.91□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 TRP2YER090W 1524 nt7.91□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 HBS1YKR084C 1836 nt7.91□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 SHO1YER118C 1104 nt7.9□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 snR34snR34 203 nt7.9□□□□□ -1.14
MCD1Q12158 DPB2YPR175W 2070 nt7.9□□□□□ -1.15
MCD1Q12158 YJR115WYJR115W 510 nt7.89□□□□□ -1.15
MCD1Q12158 ARO10YDR380W 1908 nt7.89□□□□□ -1.15
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