Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNA1Q09470 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNA1Q09470 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KCNA1Q09470 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNA1Q09470 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNA1Q09470 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms