Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RELAQ04206 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RELAQ04206 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RELAQ04206 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RELAQ04206 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RELAQ04206 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RELAQ04206 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RELAQ04206 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RELAQ04206 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RELAQ04206 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RELAQ04206 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RELAQ04206 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RELAQ04206 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RELAQ04206 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RELAQ04206 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RELAQ04206 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RELAQ04206 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RELAQ04206 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RELAQ04206 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RELAQ04206 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RELAQ04206 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RELAQ04206 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RELAQ04206 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RELAQ04206 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RELAQ04206 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RELAQ04206 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RELAQ04206 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RELAQ04206 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RELAQ04206 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RELAQ04206 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RELAQ04206 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RELAQ04206 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RELAQ04206 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RELAQ04206 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RELAQ04206 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RELAQ04206 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RELAQ04206 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RELAQ04206 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RELAQ04206 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RELAQ04206 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RELAQ04206 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RELAQ04206 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RELAQ04206 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RELAQ04206 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RELAQ04206 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RELAQ04206 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RELAQ04206 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RELAQ04206 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RELAQ04206 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RELAQ04206 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RELAQ04206 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RELAQ04206 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RELAQ04206 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RELAQ04206 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RELAQ04206 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RELAQ04206 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RELAQ04206 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RELAQ04206 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RELAQ04206 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RELAQ04206 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RELAQ04206 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RELAQ04206 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RELAQ04206 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RELAQ04206 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RELAQ04206 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RELAQ04206 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RELAQ04206 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RELAQ04206 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RELAQ04206 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RELAQ04206 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RELAQ04206 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RELAQ04206 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RELAQ04206 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RELAQ04206 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RELAQ04206 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RELAQ04206 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RELAQ04206 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RELAQ04206 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RELAQ04206 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RELAQ04206 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RELAQ04206 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELAQ04206 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELAQ04206 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELAQ04206 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELAQ04206 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELAQ04206 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELAQ04206 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELAQ04206 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RELAQ04206 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELAQ04206 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELAQ04206 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELAQ04206 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELAQ04206 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELAQ04206 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELAQ04206 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELAQ04206 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RELAQ04206 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RELAQ04206 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RELAQ04206 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RELAQ04206 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms