Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KCNC4Q03721 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNC4Q03721 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
KCNC4Q03721 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNC4Q03721 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms