Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
TOP2BQ02880 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC43.33■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
TOP2BQ02880 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TOP2BQ02880 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC43.21■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TOP2BQ02880 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC43.19■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC43.16■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TOP2BQ02880 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.09■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
TOP2BQ02880 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TOP2BQ02880 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC42.98■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC42.95■■■■■ 4.47
TOP2BQ02880 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
TOP2BQ02880 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms