Protein–RNA interactions for Protein: P97770

Thumpd3, THUMP domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd3P97770 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Thumpd3P97770 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Thumpd3P97770 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Thumpd3P97770 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Thumpd3P97770 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms