Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRTAP10-9P60411 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KRTAP10-9P60411 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KRTAP10-9P60411 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KRTAP10-9P60411 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms