Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MCCD1P59942 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MCCD1P59942 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MCCD1P59942 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCCD1P59942 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCCD1P59942 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCCD1P59942 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MCCD1P59942 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MCCD1P59942 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCCD1P59942 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MCCD1P59942 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MCCD1P59942 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MCCD1P59942 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCCD1P59942 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCCD1P59942 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCCD1P59942 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MCCD1P59942 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCCD1P59942 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MCCD1P59942 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MCCD1P59942 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MCCD1P59942 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
MCCD1P59942 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MCCD1P59942 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
MCCD1P59942 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MCCD1P59942 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MCCD1P59942 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms