Protein–RNA interactions for Protein: P51793

CLCN4, H(+)/Cl(-) exchange transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN4P51793 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CLCN4P51793 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CLCN4P51793 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CLCN4P51793 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CLCN4P51793 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CLCN4P51793 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CLCN4P51793 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms