Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

Predictions only

Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 DST1YGL043W 930 nt8.83□□□□□ -1
VID28P40547 UFD1YGR048W 1086 nt8.83□□□□□ -1
VID28P40547 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.83□□□□□ -1
VID28P40547 RFC1YOR217W 2586 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 ADE1YAR015W 921 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 APT1YML022W 564 nt8.82□□□□□ -1
VID28P40547 MET13YGL125W 1803 nt8.81□□□□□ -1
VID28P40547 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.78□□□□□ -1
VID28P40547 ADE16YLR028C 1776 nt8.78□□□□□ -1
VID28P40547 YIL177CYIL177C 5277 nt8.77□□□□□ -1
VID28P40547 CPR2YHR057C 618 nt8.77□□□□□ -1.01
VID28P40547 NUP53YMR153W 1428 nt8.77□□□□□ -1.01
VID28P40547 PMT7YDR307W 1989 nt8.75□□□□□ -1.01
VID28P40547 CDA1YLR307W 906 nt8.75□□□□□ -1.01
VID28P40547 AOS1YPR180W 1044 nt8.75□□□□□ -1.01
VID28P40547 PSP2YML017W 1782 nt8.75□□□□□ -1.01
VID28P40547 LPD1YFL018C 1500 nt8.75□□□□□ -1.01
VID28P40547 FIT1YDR534C 1587 nt8.74□□□□□ -1.01
VID28P40547 MNN9YPL050C 1188 nt8.74□□□□□ -1.01
VID28P40547 HAC1YFL031W 717 nt8.73□□□□□ -1.01
VID28P40547 TOS1YBR162C 1368 nt8.73□□□□□ -1.01
VID28P40547 AVL9YLR114C 2295 nt8.72□□□□□ -1.01
VID28P40547 HAM1YJR069C 594 nt8.72□□□□□ -1.01
VID28P40547 MDH2YOL126C 1134 nt8.72□□□□□ -1.01
VID28P40547 SPR1YOR190W 1338 nt8.72□□□□□ -1.01
VID28P40547 STE3YKL178C 1413 nt8.71□□□□□ -1.01
VID28P40547 YJL043WYJL043W 774 nt8.71□□□□□ -1.02
VID28P40547 YOR268CYOR268C 399 nt8.71□□□□□ -1.02
VID28P40547 PNS1YOR161C 1620 nt8.71□□□□□ -1.02
VID28P40547 PDC5YLR134W 1692 nt8.71□□□□□ -1.02
VID28P40547 TES1YJR019C 1050 nt8.7□□□□□ -1.02
VID28P40547 PAB1YER165W 1734 nt8.7□□□□□ -1.02
VID28P40547 RSC4YKR008W 1878 nt8.69□□□□□ -1.02
VID28P40547 CPT1YNL130C 1182 nt8.69□□□□□ -1.02
VID28P40547 MAS1YLR163C 1389 nt8.69□□□□□ -1.02
VID28P40547 YNL295WYNL295W 1575 nt8.69□□□□□ -1.02
VID28P40547 PEX28YHR150W 1740 nt8.68□□□□□ -1.02
VID28P40547 CKB1YGL019W 837 nt8.67□□□□□ -1.02
VID28P40547 RRT6YGL146C 936 nt8.67□□□□□ -1.02
VID28P40547 PFS2YNL317W 1398 nt8.67□□□□□ -1.02
VID28P40547 NCA3YJL116C 1014 nt8.66□□□□□ -1.02
VID28P40547 VPS65YLR322W 315 nt8.66□□□□□ -1.02
VID28P40547 ERV25YML012W 636 nt8.66□□□□□ -1.02
VID28P40547 FUS3YBL016W 1062 nt8.66□□□□□ -1.02
VID28P40547 RRP43YCR035C 1185 nt8.65□□□□□ -1.02
VID28P40547 SNA3YJL151C 402 nt8.65□□□□□ -1.02
VID28P40547 SGF73YGL066W 1974 nt8.64□□□□□ -1.03
VID28P40547 HSV2YGR223C 1347 nt8.64□□□□□ -1.03
VID28P40547 KAE1YKR038C 1161 nt8.64□□□□□ -1.03
VID28P40547 EDC2YER035W 438 nt8.63□□□□□ -1.03
VID28P40547 YHR033WYHR033W 1272 nt8.63□□□□□ -1.03
VID28P40547 CSM2YIL132C 642 nt8.63□□□□□ -1.03
VID28P40547 YML034C-AYML034C-A 399 nt8.63□□□□□ -1.03
VID28P40547 ALR1YOL130W 2580 nt8.62□□□□□ -1.03
VID28P40547 YDR215CYDR215C 414 nt8.62□□□□□ -1.03
VID28P40547 MFG1YDL233W 1377 nt8.61□□□□□ -1.03
VID28P40547 RUP1YOR138C 2016 nt8.61□□□□□ -1.03
VID28P40547 YDR476CYDR476C 675 nt8.61□□□□□ -1.03
VID28P40547 CRN1YLR429W 1956 nt8.61□□□□□ -1.03
VID28P40547 TOM71YHR117W 1920 nt8.6□□□□□ -1.03
VID28P40547 RCF2YNR018W 675 nt8.6□□□□□ -1.03
VID28P40547 RSC9YML127W 1746 nt8.6□□□□□ -1.03
VID28P40547 PET494YNR045W 1470 nt8.59□□□□□ -1.03
VID28P40547 DAL80YKR034W 810 nt8.59□□□□□ -1.03
VID28P40547 INP54YOL065C 1155 nt8.59□□□□□ -1.03
VID28P40547 ERV2YPR037C 591 nt8.59□□□□□ -1.03
VID28P40547 SPS1YDR523C 1473 nt8.58□□□□□ -1.04
VID28P40547 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.58□□□□□ -1.04
VID28P40547 YPC1YBR183W 951 nt8.58□□□□□ -1.04
VID28P40547 YBL113CYBL113C 2379 nt8.56□□□□□ -1.04
VID28P40547 SLM3YDL033C 1254 nt8.56□□□□□ -1.04
VID28P40547 PSA1YDL055C 1086 nt8.56□□□□□ -1.04
VID28P40547 LEO1YOR123C 1395 nt8.56□□□□□ -1.04
VID28P40547 PET10YKR046C 852 nt8.55□□□□□ -1.04
VID28P40547 MCM5YLR274W 2328 nt8.55□□□□□ -1.04
VID28P40547 BDS1YOL164W 1941 nt8.54□□□□□ -1.04
VID28P40547 YJR142WYJR142W 1029 nt8.53□□□□□ -1.04
VID28P40547 PPZ2YDR436W 2133 nt8.53□□□□□ -1.04
VID28P40547 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.53□□□□□ -1.04
VID28P40547 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.53□□□□□ -1.04
VID28P40547 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.53□□□□□ -1.04
VID28P40547 MET30YIL046W 1923 nt8.52□□□□□ -1.04
VID28P40547 NMA2YGR010W 1188 nt8.52□□□□□ -1.05
VID28P40547 OPI1YHL020C 1215 nt8.51□□□□□ -1.05
VID28P40547 CAR2YLR438W 1275 nt8.51□□□□□ -1.05
VID28P40547 HOG1YLR113W 1308 nt8.51□□□□□ -1.05
VID28P40547 HNM1YGL077C 1692 nt8.5□□□□□ -1.05
VID28P40547 YNL190WYNL190W 615 nt8.5□□□□□ -1.05
VID28P40547 GET2YER083C 858 nt8.49□□□□□ -1.05
VID28P40547 STS1YIR011C 960 nt8.49□□□□□ -1.05
VID28P40547 CKI1YLR133W 1749 nt8.49□□□□□ -1.05
VID28P40547 HRB1YNL004W 1365 nt8.48□□□□□ -1.05
VID28P40547 YDR306CYDR306C 1437 nt8.48□□□□□ -1.05
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