Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TNNI3P19429 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TNNI3P19429 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNNI3P19429 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNNI3P19429 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms