Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD58P19256 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CD58P19256 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CD58P19256 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD58P19256 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CD58P19256 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CD58P19256 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD58P19256 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD58P19256 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD58P19256 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CD58P19256 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CD58P19256 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD58P19256 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD58P19256 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CD58P19256 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD58P19256 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD58P19256 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CD58P19256 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD58P19256 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CD58P19256 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD58P19256 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CD58P19256 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD58P19256 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD58P19256 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD58P19256 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD58P19256 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD58P19256 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CD58P19256 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD58P19256 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD58P19256 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CD58P19256 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD58P19256 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CD58P19256 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CD58P19256 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD58P19256 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD58P19256 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD58P19256 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD58P19256 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD58P19256 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD58P19256 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CD58P19256 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD58P19256 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD58P19256 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD58P19256 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD58P19256 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CD58P19256 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CD58P19256 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD58P19256 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD58P19256 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CD58P19256 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD58P19256 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD58P19256 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD58P19256 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CD58P19256 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD58P19256 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CD58P19256 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CD58P19256 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD58P19256 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CD58P19256 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CD58P19256 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD58P19256 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD58P19256 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD58P19256 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD58P19256 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD58P19256 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD58P19256 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CD58P19256 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD58P19256 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD58P19256 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CD58P19256 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD58P19256 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD58P19256 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD58P19256 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CD58P19256 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CD58P19256 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD58P19256 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CD58P19256 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms