Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PTPRFP10586 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRFP10586 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPRFP10586 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPRFP10586 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRFP10586 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms