Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCO2O43819 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCO2O43819 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCO2O43819 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCO2O43819 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCO2O43819 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCO2O43819 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCO2O43819 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCO2O43819 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCO2O43819 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCO2O43819 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCO2O43819 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCO2O43819 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCO2O43819 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCO2O43819 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCO2O43819 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCO2O43819 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCO2O43819 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCO2O43819 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCO2O43819 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCO2O43819 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCO2O43819 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCO2O43819 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCO2O43819 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCO2O43819 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCO2O43819 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCO2O43819 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCO2O43819 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCO2O43819 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCO2O43819 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCO2O43819 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCO2O43819 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCO2O43819 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCO2O43819 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCO2O43819 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCO2O43819 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCO2O43819 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCO2O43819 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCO2O43819 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCO2O43819 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCO2O43819 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCO2O43819 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCO2O43819 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCO2O43819 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCO2O43819 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCO2O43819 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCO2O43819 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCO2O43819 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCO2O43819 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCO2O43819 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SCO2O43819 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCO2O43819 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCO2O43819 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCO2O43819 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCO2O43819 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCO2O43819 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCO2O43819 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCO2O43819 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCO2O43819 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCO2O43819 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCO2O43819 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SCO2O43819 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCO2O43819 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SCO2O43819 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCO2O43819 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SCO2O43819 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCO2O43819 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SCO2O43819 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SCO2O43819 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCO2O43819 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCO2O43819 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCO2O43819 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCO2O43819 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCO2O43819 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SCO2O43819 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCO2O43819 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SCO2O43819 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms