Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NDUFB5O43674 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFB5O43674 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFB5O43674 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFB5O43674 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms