Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAB19A4D1S5 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAB19A4D1S5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB19A4D1S5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB19A4D1S5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms