Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYT5

KRTAP2-2, Keratin-associated protein 2-2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM111A-202ENST00000420244 3780 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 APBB2-224ENST00000513140 4166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TXNRD1-208ENST00000525566 3836 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 GTF2H1-201ENST00000265963 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 NOTCH2-206ENST00000579475 2954 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 OR2T10-202ENST00000642090 3519 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF35-202ENST00000396056 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 NECAP1-221ENST00000639955 3479 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 Z97832.2-201ENST00000605896 4261 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 LMO7-207ENST00000465261 5580 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ANKRD54P1-201ENST00000433115 471 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ZBTB21-204ENST00000398505 6846 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 KCNN3-201ENST00000271915 13033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP2-2Q9BYT5 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms