Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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TRAF3Q13114 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
TRAF3Q13114 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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