Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 NBPF14-209ENST00000620240 2656 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LRRTM4-205ENST00000409911 2976 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LINC-ROR-201ENST00000553704 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms