Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
ATP1A4Q13733 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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