Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
IFT88Q13099 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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IFT88Q13099 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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IFT88Q13099 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
IFT88Q13099 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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