Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 LINC01415-201ENST00000587320 4071 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
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FOXC1Q12948 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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FOXC1Q12948 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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FOXC1Q12948 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
FOXC1Q12948 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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